В недалеком будущем общество озабочено проблемой следующего этапа эволюции человека. С помощью генетических мутаций выводятся человеческие организмы, обладающие огромной силой и невероятными способностями. Обычные люди опасаются мест, где появляются поселения «мутантов». Профессор Чарльз Ксавьер (Патрик Стюарт), занимающийся генетическим усовершенствованием человеческого организма, мечтает о мирном сосуществовании людей и мутантов. Однако его коллега-противник Магнето (Ян МакКеллен) разрабатывает сумасбродные планы.